Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX6Q9UNH7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX6Q9UNH7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms