Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF112Q9ULX5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF112Q9ULX5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms