Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms