Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSD3Q9NYI0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms