Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIT2Q9NQR4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIT2Q9NQR4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms