Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED4Q9NPJ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms