Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6BQ9H3T3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6BQ9H3T3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms