Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A4Q9H015 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms