Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CFAP74Q9C0B2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP74Q9C0B2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms