Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMES1Q9C002 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms