Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms