Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms