Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms