Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms