Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms