Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSGA13Q96PP4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms