Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms