Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RMDN2Q96LZ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN2Q96LZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN2Q96LZ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms