Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39BQ96DA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms