Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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