Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SCRN2-209ENST00000582459 1624 ntTSL 517.25■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EXOC5-204ENST00000554598 772 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 417.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-222ENST00000582991 2152 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RPS5-207ENST00000599232 1747 nt17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-225ENST00000582455 564 ntTSL 417.02■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MYRF-205ENST00000537318 1844 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABR-227ENST00000574266 597 ntTSL 316.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-208ENST00000467999 747 ntTSL 516.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.36e-10■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TRNT1-206ENST00000413000 483 ntTSL 416.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MRPS2-208ENST00000488610 928 ntTSL 316.91■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-214ENST00000513978 1847 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DNAJB1-203ENST00000594099 995 ntTSL 416.87■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.289e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IL4I1-206ENST00000596022 747 ntTSL 216.79■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SFSWAP-205ENST00000537164 961 ntTSL 516.79■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EVPL-203ENST00000587569 6592 ntTSL 216.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PFAS-203ENST00000578979 765 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GPR89B-205ENST00000488165 1954 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53I13-205ENST00000578749 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 HAUS4-216ENST00000555040 1107 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RBMS1-214ENST00000491781 1533 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 216.62■□□□□ 0.259e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR41-219ENST00000511791 429 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EBF4-204ENST00000463145 642 ntTSL 516.62■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MYO1B-205ENST00000418908 572 ntTSL 416.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 USP28-208ENST00000540438 3015 ntTSL 216.58■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IFT74-210ENST00000519968 652 ntTSL 316.57■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 516.57■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PFAS-202ENST00000546020 2652 ntTSL 216.31■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COL16A1-204ENST00000440437 672 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CDKN1B-203ENST00000442489 577 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 SCAMP2-208ENST00000566557 585 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG4B-216ENST00000475195 762 ntTSL 216.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53I13-211ENST00000583940 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.01■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-208ENST00000520813 562 ntTSL 416.01■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TGFA-202ENST00000394241 568 ntTSL 315.96■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-10■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PIK3C2A-204ENST00000532035 584 ntTSL 315.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTGES2-205ENST00000476655 1063 ntTSL 315.84■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 515.77■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 62.8
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