Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms