Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNBD1Q8NA66 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms