Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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