Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf62Q8N4C0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms