Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms