Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF13Q86YI8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms