Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PALB2Q86YC2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PALB2Q86YC2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms