Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms