Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAL3Q7RTP6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAL3Q7RTP6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms