Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM47EQ6ZV65 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM47EQ6ZV65 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms