Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRQ5

MMS22L, Protein MMS22-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS22LQ6ZRQ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMS22LQ6ZRQ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMS22LQ6ZRQ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms