Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms