Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO38Q6PIJ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.6 ms