Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM88Q6PEY1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM88Q6PEY1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms