Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms