Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GFI1BQ5VTD9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GFI1BQ5VTD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFI1BQ5VTD9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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