Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPEL1Q2QD12 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPEL1Q2QD12 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms