Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms