Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGISQ16647 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms