Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1EQ15878 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms