Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1AQ15573 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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