Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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