Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 519.8■□□□□ 0.762e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 RPL4-209ENST00000565723 408 ntTSL 310.54□□□□□ -0.728e-58■■□□□ 14
PUM1Q14671 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.388e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.138e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 MGEA5-209ENST00000482611 1664 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.468e-9■■□□□ 14
PUM1Q14671 NSRP1-211ENST00000584154 583 ntTSL 311.36□□□□□ -0.596e-9■■□□□ 14
PUM1Q14671 NSRP1-208ENST00000580103 774 ntTSL 510.78□□□□□ -0.686e-9■■□□□ 14
PUM1Q14671 NSRP1-207ENST00000577289 562 ntTSL 58.55□□□□□ -1.046e-9■■□□□ 14
PUM1Q14671 NSRP1-215ENST00000588614 497 ntTSL 26.48□□□□□ -1.376e-9■■□□□ 14
PUM1Q14671 PSIP1-206ENST00000463712 730 ntTSL 522.86■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 PSIP1-210ENST00000488797 736 ntTSL 322.31■■□□□ 1.162e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 PSIP1-208ENST00000484265 2065 ntTSL 218.43■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 ZCCHC11-211ENST00000474453 1010 ntTSL 59.04□□□□□ -0.963e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ZCCHC11-207ENST00000470212 775 ntTSL 25.84□□□□□ -1.473e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ZCCHC11-206ENST00000469810 3757 ntTSL 25.7□□□□□ -1.53e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ZCCHC11-221ENST00000531722 1016 ntTSL 35.44□□□□□ -1.543e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.24e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.934e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 NSRP1-209ENST00000581048 547 ntTSL 49.05□□□□□ -0.967e-11■■□□□ 14
PUM1Q14671 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -13e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.113e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.263e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 NUCB2-205ENST00000527580 701 ntTSL 55.95□□□□□ -1.463e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 NUCB2-217ENST00000533773 1839 ntTSL 53.77□□□□□ -1.813e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 MRPS15-204ENST00000488606 2127 ntTSL 28.26□□□□□ -1.093e-10■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.927e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.64■□□□□ 0.257e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 ACTN4-209ENST00000586538 546 ntTSL 511.96□□□□□ -0.497e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 XPC-205ENST00000476581 2944 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.645e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SARNP-202ENST00000546604 1163 ntTSL 211.79□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SARNP-204ENST00000552207 2242 ntTSL 210.94□□□□□ -0.663e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SARNP-205ENST00000552884 997 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.13e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.183e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.753e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 229.71■■■□□ 2.354e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 LARS-204ENST00000504323 608 ntTSL 39.45□□□□□ -0.93e-9■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 LARS-210ENST00000508667 707 ntTSL 38.94□□□□□ -0.983e-9■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 LARS-209ENST00000507095 384 ntTSL 35.62□□□□□ -1.513e-9■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 H2AFY-214ENST00000508962 293 ntTSL 311.69□□□□□ -0.547e-13■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.426e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.536e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.68e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.588e-7■■□□□ 13.9
PUM1Q14671 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 TPM4-215ENST00000592138 635 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 TPM4-210ENST00000588507 367 ntTSL 39.14□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.762e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-17■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 DNTTIP2-201ENST00000359208 2199 ntTSL 27.36□□□□□ -1.237e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.57e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 210.27□□□□□ -0.764e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 26.91□□□□□ -1.34e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 PFDN5-210ENST00000550513 939 ntTSL 311.79□□□□□ -0.525e-10■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.28e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.948e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 GMNN-206ENST00000476555 580 ntTSL 315.38■□□□□ 0.055e-15■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.018e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RCN2-205ENST00000558598 3936 ntTSL 27.48□□□□□ -1.218e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RCN2-206ENST00000560833 683 ntTSL 24.13□□□□□ -1.758e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.822e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.552e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 59.74□□□□□ -0.852e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.892e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 28.53□□□□□ -1.042e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.232e-19■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 DDX23-207ENST00000550834 869 ntTSL 513.23□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 DDX23-203ENST00000547165 958 ntTSL 57.75□□□□□ -1.171e-6■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 SMARCC2-212ENST00000552566 534 ntTSL 214.78□□□□□ -0.044e-8■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 SMARCC2-205ENST00000548130 1238 ntTSL 58.93□□□□□ -0.984e-8■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.614e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 514.78□□□□□ -0.044e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 210.81□□□□□ -0.684e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.76□□□□□ -2.134e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 SF3B2-204ENST00000525207 493 ntTSL 29.97□□□□□ -0.814e-8■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 EIF3B-204ENST00000431643 1074 ntTSL 517.46■□□□□ 0.396e-8■■□□□ 13.8
PUM1Q14671 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.587e-7■■□□□ 13.7
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 157.7 ms