Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms