Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCINQ13939 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCINQ13939 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCINQ13939 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCINQ13939 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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