Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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