Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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