Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RPA4Q13156 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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