Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPS1Q13098 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms